Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
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FOXF1Q12946 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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FOXF1Q12946 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXF1Q12946 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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FOXF1Q12946 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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