Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRNQ16849 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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