Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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TMED1Q13445 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TMED1Q13445 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TMED1Q13445 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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TMED1Q13445 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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TMED1Q13445 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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TMED1Q13445 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
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TMED1Q13445 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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TMED1Q13445 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
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TMED1Q13445 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TMED1Q13445 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
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