Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SYCP1Q15431 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SYCP1Q15431 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
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SYCP1Q15431 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SYCP1Q15431 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
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