Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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PTPRBP23467 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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PTPRBP23467 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PTPRBP23467 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
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PTPRBP23467 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRBP23467 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRBP23467 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
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PTPRBP23467 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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PTPRBP23467 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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