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Protein–RNA interactions for Protein: O14815
CAPN9, Calpain-9, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CAPN9
O14815
Y_RNA.107-201
ENST00000363190
121 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
RNU7-61P-201
ENST00000515897
61 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
RNU6-1265P-201
ENST00000516342
103 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
SCARNA16.5-201
ENST00000517114
183 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
RNU4ATAC9P-201
ENST00000517146
126 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
AP001318.4-201
ENST00000616637
121 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CAPN9
O14815
Y_RNA.93-201
ENST00000363066
109 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
AC114737.2-201
ENST00000421583
173 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
AC023932.2-201
ENST00000603176
175 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNA5SP499-201
ENST00000363982
119 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-1229P-201
ENST00000364295
107 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.348-201
ENST00000365403
103 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
SNORA8.2-201
ENST00000384372
139 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-243P-201
ENST00000391140
107 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MTATP8P2-201
ENST00000435212
202 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU7-104P-201
ENST00000459398
79 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNA5SP268-201
ENST00000516828
124 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-158P-201
ENST00000517104
100 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
AC092634.7-201
ENST00000621022
103 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
VPS35-212
ENST00000640313
141 nt
TSL 5
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.495-201
ENST00000384435
112 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MIR329-2-201
ENST00000385029
84 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.705-201
ENST00000516862
110 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
SNORA25.18-201
ENST00000607153
114 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
ZNRD1-AS1_1.6-201
ENST00000610339
68 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MIR7107-201
ENST00000611489
80 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
NEAT1_2.1-201
ENST00000620525
105 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-726P-201
ENST00000364680
107 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-32P-201
ENST00000383948
107 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-13P-201
ENST00000384248
107 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-12P-201
ENST00000384604
107 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-41P-201
ENST00000384741
107 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-887P-201
ENST00000410660
100 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RN7SKP12-201
ENST00000516275
143 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
SNORD118-201
ENST00000363593
134 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
SNORD58A-201
ENST00000383875
65 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-905P-201
ENST00000384434
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU7-85P-201
ENST00000458851
63 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.648-201
ENST00000459455
110 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-75P-201
ENST00000515944
104 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-162P-201
ENST00000516228
103 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MIR3920-201
ENST00000581751
86 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
U7.3-201
ENST00000616123
62 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
U6.100-201
ENST00000636230
99 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.283-201
ENST00000364798
112 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
Y_RNA.290-201
ENST00000364879
114 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
SNORD41.1-201
ENST00000391000
69 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNA5SP89-201
ENST00000410300
108 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNA5SP227-201
ENST00000516184
113 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
RNU6-168P-201
ENST00000516189
101 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MIR548AG2-201
ENST00000581228
64 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CAPN9
O14815
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORA40.8-201
ENST00000411034
126 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORA68.3-201
ENST00000515906
83 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
AC067863.3-201
ENST00000624172
122 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
CEP290-203
ENST00000547691
5968 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
Y_RNA.190-201
ENST00000363964
101 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR488-201
ENST00000365739
83 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
LINC00345-201
ENST00000443679
285 nt
TSL 5
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR4636-201
ENST00000582271
80 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MTRNR2L2-201
ENST00000604882
87 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR6759-201
ENST00000638110
65 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
AC069271.1-201
ENST00000445577
156 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
snoU13.19-201
ENST00000459148
104 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU7-13P-201
ENST00000516413
62 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU1-29P-201
ENST00000606574
126 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
AL162376.1-201
ENST00000624117
175 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
Y_RNA.96-201
ENST00000363092
109 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU6-1126P-201
ENST00000384002
107 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
Y_RNA.677-201
ENST00000516401
85 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU6-269P-201
ENST00000391077
97 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
Y_RNA.596-201
ENST00000410462
109 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORD4B-201
ENST00000459083
72 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORD44.1-201
ENST00000363202
61 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR548L-201
ENST00000408303
86 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
SNORD71-201
ENST00000411292
86 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
RNU6-287P-201
ENST00000516230
98 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
AC026421.1-201
ENST00000519101
163 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR5589-201
ENST00000579442
60 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR6755-201
ENST00000619993
66 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIR2052-201
ENST00000636055
55 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
CAPN9
O14815
MIRLET7D-201
ENST00000362263
87 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
Y_RNA.207-201
ENST00000364142
106 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
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