Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
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SHROOM2Q13796 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHROOM2Q13796 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.82□□□□□ -2.86
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SHROOM2Q13796 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHROOM2Q13796 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHROOM2Q13796 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
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