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Protein–RNA interactions for Protein: Q15532
SS18, Protein SSXT, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SS18
Q15532
Y_RNA.350-201
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-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-811P-201
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107 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.447-201
ENST00000384184
113 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.459-201
ENST00000384251
102 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORA75.5-201
ENST00000391291
81 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-1006P-201
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103 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU7-188P-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
CR383656.4-201
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122 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AL590491.3-201
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82 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AP001362.1-201
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124 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
U6.100-201
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99 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.11-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.98-201
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102 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORA18.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.193-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU4-84P-201
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139 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.233-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-46P-201
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107 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR548I2-201
ENST00000408348
149 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNA5SP25-201
ENST00000410815
110 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC109327.2-201
ENST00000448339
378 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-1023P-201
ENST00000516137
106 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.690-201
ENST00000516603
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU5B-6P-201
ENST00000516765
68 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.812-201
ENST00000610788
101 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.784-201
ENST00000613803
101 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.787-201
ENST00000616522
101 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.780-201
ENST00000617336
101 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.801-201
ENST00000619005
101 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC084368.1-201
ENST00000620935
65 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORD36A-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORD115-19-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORD115-18-201
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82 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.149-201
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117 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORD114-11-201
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNA5SP275-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-312P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORD49B-201
ENST00000365172
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR539-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.422-201
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114 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
SNORA51.5-201
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BASIC
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SS18
Q15532
SNORA75.1-201
ENST00000391130
148 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC096531.1-201
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107 nt
BASIC
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SS18
Q15532
MIR2113-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC074198.2-201
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258 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC107027.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU7-13P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-521P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.696-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR4503-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC145423.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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120 nt
BASIC
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SS18
Q15532
MIR6844-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-509P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
RNU6-682P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
Y_RNA.200-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
Y_RNA.342-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-571P-201
ENST00000384128
107 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
SNORA49-201
ENST00000386157
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-239P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-460P-201
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108 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNA5SP300-201
ENST00000391197
107 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
SCARNA15.1-201
ENST00000516384
125 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-1234P-201
ENST00000516877
103 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MIR3121-201
ENST00000579680
77 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
YWHAEP2-201
ENST00000580066
112 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
U6.104-201
ENST00000637979
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
Y_RNA.83-201
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113 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-1244P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU6-1130P-201
ENST00000365434
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
Y_RNA.785-201
ENST00000384290
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MIR617-201
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97 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MTND3P2-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
SNORD126-201
ENST00000459475
77 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU7-6P-201
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62 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU4ATAC9P-201
ENST00000517146
126 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MIR3646-201
ENST00000578301
84 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MTRNR2L2-201
ENST00000604882
87 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
RNU7-10P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
U7.6-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
MIR8064-201
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BASIC
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SS18
Q15532
AC069503.3-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SS18
Q15532
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
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