Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGN3Q15651 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGN3Q15651 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGN3Q15651 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
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