Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APAF1O14727 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APAF1O14727 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APAF1O14727 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APAF1O14727 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APAF1O14727 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APAF1O14727 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APAF1O14727 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APAF1O14727 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APAF1O14727 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
APAF1O14727 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APAF1O14727 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APAF1O14727 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APAF1O14727 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APAF1O14727 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
APAF1O14727 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APAF1O14727 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
APAF1O14727 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APAF1O14727 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APAF1O14727 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APAF1O14727 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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