Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SHROOM2Q13796 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
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SHROOM2Q13796 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
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SHROOM2Q13796 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.48□□□□□ -2.81
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SHROOM2Q13796 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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SHROOM2Q13796 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SHROOM2Q13796 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.82
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