Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDB1Q16531 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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