Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXC1Q12948 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXC1Q12948 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXC1Q12948 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FOXC1Q12948 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXC1Q12948 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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