Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3CA6NKF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3CA6NKF2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms