Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF1Q13077 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRAF1Q13077 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF1Q13077 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF1Q13077 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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