Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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ATRQ13535 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATRQ13535 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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