Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRAP18433 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRAP18433 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRAP18433 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRAP18433 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRAP18433 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRAP18433 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRAP18433 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRAP18433 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRAP18433 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRAP18433 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRAP18433 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms