Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN3O15551 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN3O15551 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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