Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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RPE65Q16518 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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RPE65Q16518 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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RPE65Q16518 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RPE65Q16518 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
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RPE65Q16518 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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