Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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VPREB3Q9UKI3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VPREB3Q9UKI3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VPREB3Q9UKI3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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