Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMG1C9JSJ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BHMG1C9JSJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms