Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
BBS9Q3SYG4 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BBS9Q3SYG4 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms