Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms