Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.5 ms