Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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