Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF235Q14590 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF235Q14590 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms