Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRTO14522 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.22
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