Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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