Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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