Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COL9A2Q14055 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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