Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCSO14618 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCSO14618 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCSO14618 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCSO14618 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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