Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms