Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
WDR53Q7Z5U6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1510.2 ms