Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT33BQ14525 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms