Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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