Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
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FOXD4Q12950 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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