Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMAPO00193 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SMAPO00193 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SMAPO00193 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SMAPO00193 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SMAPO00193 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SMAPO00193 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SMAPO00193 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SMAPO00193 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SMAPO00193 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms