Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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PTPRTO14522 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRTO14522 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRTO14522 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRTO14522 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRTO14522 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRTO14522 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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PTPRTO14522 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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PTPRTO14522 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRTO14522 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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PTPRTO14522 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRTO14522 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRTO14522 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRTO14522 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRTO14522 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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