Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KLF9Q13886 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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