Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFLP07196 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms