Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HECTD4Q9Y4D8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HECTD4Q9Y4D8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms