Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP2-2Q9BYT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP2-2Q9BYT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP2-2Q9BYT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms