Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CpQ61147 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CpQ61147 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CpQ61147 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CpQ61147 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CpQ61147 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CpQ61147 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CpQ61147 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CpQ61147 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CpQ61147 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CpQ61147 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CpQ61147 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CpQ61147 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CpQ61147 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CpQ61147 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CpQ61147 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CpQ61147 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CpQ61147 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CpQ61147 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CpQ61147 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CpQ61147 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CpQ61147 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CpQ61147 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CpQ61147 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CpQ61147 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CpQ61147 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CpQ61147 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpQ61147 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpQ61147 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CpQ61147 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpQ61147 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CpQ61147 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CpQ61147 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CpQ61147 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CpQ61147 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpQ61147 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpQ61147 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CpQ61147 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CpQ61147 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpQ61147 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpQ61147 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpQ61147 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpQ61147 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CpQ61147 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CpQ61147 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CpQ61147 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpQ61147 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CpQ61147 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpQ61147 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CpQ61147 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CpQ61147 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CpQ61147 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CpQ61147 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CpQ61147 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CpQ61147 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CpQ61147 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CpQ61147 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CpQ61147 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CpQ61147 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CpQ61147 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CpQ61147 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CpQ61147 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CpQ61147 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CpQ61147 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CpQ61147 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms