Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CpQ61147 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CpQ61147 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CpQ61147 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CpQ61147 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CpQ61147 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CpQ61147 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CpQ61147 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CpQ61147 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CpQ61147 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CpQ61147 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CpQ61147 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CpQ61147 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CpQ61147 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CpQ61147 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CpQ61147 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CpQ61147 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CpQ61147 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CpQ61147 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CpQ61147 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CpQ61147 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CpQ61147 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CpQ61147 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CpQ61147 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CpQ61147 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CpQ61147 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CpQ61147 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CpQ61147 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CpQ61147 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CpQ61147 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CpQ61147 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CpQ61147 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CpQ61147 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CpQ61147 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CpQ61147 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CpQ61147 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CpQ61147 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CpQ61147 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CpQ61147 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CpQ61147 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CpQ61147 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CpQ61147 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CpQ61147 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CpQ61147 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CpQ61147 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CpQ61147 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CpQ61147 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CpQ61147 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CpQ61147 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CpQ61147 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CpQ61147 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CpQ61147 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CpQ61147 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CpQ61147 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CpQ61147 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CpQ61147 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CpQ61147 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CpQ61147 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CpQ61147 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CpQ61147 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CpQ61147 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CpQ61147 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CpQ61147 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CpQ61147 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CpQ61147 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CpQ61147 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CpQ61147 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CpQ61147 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CpQ61147 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CpQ61147 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CpQ61147 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CpQ61147 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CpQ61147 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CpQ61147 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CpQ61147 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CpQ61147 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CpQ61147 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CpQ61147 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CpQ61147 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CpQ61147 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CpQ61147 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CpQ61147 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CpQ61147 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CpQ61147 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CpQ61147 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CpQ61147 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CpQ61147 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CpQ61147 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CpQ61147 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CpQ61147 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CpQ61147 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CpQ61147 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CpQ61147 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CpQ61147 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CpQ61147 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CpQ61147 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CpQ61147 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CpQ61147 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CpQ61147 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CpQ61147 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms