Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 RSM7YJR113C 744 nt7.43□□□□□ -1.22
HER1Q12276 CYC3YAL039C 810 nt7.43□□□□□ -1.22
HER1Q12276 YOR343CYOR343C 327 nt7.43□□□□□ -1.22
HER1Q12276 PMT1YDL095W 2454 nt7.42□□□□□ -1.22
HER1Q12276 YER137CYER137C 447 nt7.42□□□□□ -1.22
HER1Q12276 YGR137WYGR137W 375 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 RCR1YBR005W 642 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 PAU21YOR394W 495 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 PAU22YPL282C 495 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 ALG7YBR243C 1347 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 EHT1YBR177C 1356 nt7.4□□□□□ -1.22
HER1Q12276 PAB1YER165W 1734 nt7.4□□□□□ -1.23
HER1Q12276 ECM10YEL030W 1935 nt7.4□□□□□ -1.23
HER1Q12276 AVL9YLR114C 2295 nt7.4□□□□□ -1.23
HER1Q12276 MAS2YHR024C 1449 nt7.39□□□□□ -1.23
HER1Q12276 ARO3YDR035W 1113 nt7.39□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YFR020WYFR020W 699 nt7.39□□□□□ -1.23
HER1Q12276 SRP102YKL154W 735 nt7.39□□□□□ -1.23
HER1Q12276 PDC5YLR134W 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 NDE1YMR145C 1683 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 WSC3YOL105C 1671 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 RCF1YML030W 480 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 MAL31YBR298C 1845 nt7.38□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YKR018CYKR018C 2178 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 GUT1YHL032C 2130 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YNL040WYNL040W 1371 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 SER2YGR208W 930 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YLR280CYLR280C 351 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 TPO1YLL028W 1761 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 PEX28YHR150W 1740 nt7.37□□□□□ -1.23
HER1Q12276 BNA3YJL060W 1335 nt7.36□□□□□ -1.23
HER1Q12276 RUP1YOR138C 2016 nt7.36□□□□□ -1.23
HER1Q12276 GNA1YFL017C 480 nt7.35□□□□□ -1.23
HER1Q12276 TES1YJR019C 1050 nt7.35□□□□□ -1.23
HER1Q12276 ELP6YMR312W 822 nt7.35□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YOR268CYOR268C 399 nt7.35□□□□□ -1.23
HER1Q12276 ERO1YML130C 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
HER1Q12276 YIL108WYIL108W 2091 nt7.34□□□□□ -1.23
HER1Q12276 MTC6YHR151C 1581 nt7.34□□□□□ -1.23
HER1Q12276 CDA1YLR307W 906 nt7.34□□□□□ -1.23
HER1Q12276 PRB1YEL060C 1908 nt7.34□□□□□ -1.23
HER1Q12276 HTS1YPR033C 1641 nt7.34□□□□□ -1.24
HER1Q12276 HRA1HRA1 564 nt7.33□□□□□ -1.24
HER1Q12276 YOR041CYOR041C 432 nt7.33□□□□□ -1.24
HER1Q12276 UBP13YBL067C 2244 nt7.33□□□□□ -1.24
HER1Q12276 MFG1YDL233W 1377 nt7.33□□□□□ -1.24
HER1Q12276 YGR210CYGR210C 1236 nt7.31□□□□□ -1.24
HER1Q12276 TOD6YBL054W 1578 nt7.3□□□□□ -1.24
HER1Q12276 SNA3YJL151C 402 nt7.3□□□□□ -1.24
HER1Q12276 AFG2YLR397C 2343 nt7.29□□□□□ -1.24
HER1Q12276 GRH1YDR517W 1119 nt7.29□□□□□ -1.24
HER1Q12276 SNP1YIL061C 903 nt7.29□□□□□ -1.24
HER1Q12276 YLR460CYLR460C 1131 nt7.29□□□□□ -1.24
HER1Q12276 APT1YML022W 564 nt7.28□□□□□ -1.24
HER1Q12276 LEO1YOR123C 1395 nt7.28□□□□□ -1.24
HER1Q12276 SEC24YIL109C 2781 nt7.28□□□□□ -1.24
HER1Q12276 RMD8YFR048W 1989 nt7.28□□□□□ -1.24
HER1Q12276 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 RCF2YNR018W 675 nt7.27□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YBL113CYBL113C 2379 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 CDC23YHR166C 1881 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 HXT13YEL069C 1695 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 TOS1YBR162C 1368 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 GTS1YGL181W 1191 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 OLA1YBR025C 1185 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 DCR2YLR361C 1737 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.26□□□□□ -1.25
HER1Q12276 RNA170RNA170 169 nt7.25□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YPL108WYPL108W 507 nt7.25□□□□□ -1.25
HER1Q12276 CHS7YHR142W 951 nt7.24□□□□□ -1.25
HER1Q12276 EDC2YER035W 438 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YMR166CYMR166C 1107 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 MET22YOL064C 1074 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 RFS1YBR052C 633 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YBL111CYBL111C 2004 nt7.23□□□□□ -1.25
HER1Q12276 BIM1YER016W 1035 nt7.22□□□□□ -1.25
HER1Q12276 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.22□□□□□ -1.25
HER1Q12276 FCY1YPR062W 477 nt7.22□□□□□ -1.25
HER1Q12276 HOG1YLR113W 1308 nt7.22□□□□□ -1.25
HER1Q12276 CAN1YEL063C 1773 nt7.21□□□□□ -1.25
HER1Q12276 FCP1YMR277W 2199 nt7.21□□□□□ -1.26
HER1Q12276 YKR023WYKR023W 1593 nt7.2□□□□□ -1.26
HER1Q12276 OCH1YGL038C 1443 nt7.2□□□□□ -1.26
HER1Q12276 YJL043WYJL043W 774 nt7.2□□□□□ -1.26
HER1Q12276 YMR206WYMR206W 942 nt7.2□□□□□ -1.26
HER1Q12276 LSP1YPL004C 1026 nt7.2□□□□□ -1.26
HER1Q12276 CAK1YFL029C 1107 nt7.19□□□□□ -1.26
HER1Q12276 RRT14YIL127C 621 nt7.19□□□□□ -1.26
HER1Q12276 HAM1YJR069C 594 nt7.19□□□□□ -1.26
HER1Q12276 RHO1YPR165W 630 nt7.19□□□□□ -1.26
HER1Q12276 PDC6YGR087C 1692 nt7.19□□□□□ -1.26
HER1Q12276 HXT8YJL214W 1710 nt7.18□□□□□ -1.26
HER1Q12276 MRP1YDR347W 966 nt7.18□□□□□ -1.26
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