Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 EDC2YER035W 438 nt8.04□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 WSC3YOL105C 1671 nt8.04□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 ALG7YBR243C 1347 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 MRN1YPL184C 1839 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 FTH1YBR207W 1398 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 GLY1YEL046C 1164 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 TDA4YJR116W 840 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 APT1YML022W 564 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 FUS3YBL016W 1062 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 MET30YIL046W 1923 nt8.03□□□□□ -1.12
VPS54Q12071 PSP2YML017W 1782 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 WSC4YHL028W 1818 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 HAC1YFL031W 717 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 ORT1YOR130C 879 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 TGL5YOR081C 2250 nt8.02□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 PET494YNR045W 1470 nt8.01□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 YOR268CYOR268C 399 nt8.01□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 ARG7YMR062C 1326 nt8.01□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 RRT6YGL146C 936 nt8□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 YGR137WYGR137W 375 nt8□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 NME1NME1 340 nt8□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 INM1YHR046C 888 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 SNP1YIL061C 903 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 MRP7YNL005C 1116 nt7.99□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 YNL140CYNL140C 570 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 YNL190WYNL190W 615 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 snR4snR4 186 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 SPR1YOR190W 1338 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 TIF3YPR163C 1311 nt7.98□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 ADE16YLR028C 1776 nt7.97□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 PNS1YOR161C 1620 nt7.97□□□□□ -1.13
VPS54Q12071 SNU66YOR308C 1764 nt7.95□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 NCA3YJL116C 1014 nt7.95□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 CPT1YNL130C 1182 nt7.95□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 YDR476CYDR476C 675 nt7.94□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 DST1YGL043W 930 nt7.93□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 MNN9YPL050C 1188 nt7.93□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 MTC6YHR151C 1581 nt7.93□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 ELP6YMR312W 822 nt7.92□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 LAS17YOR181W 1902 nt7.91□□□□□ -1.14
VPS54Q12071 ADE2YOR128C 1716 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 CPR2YHR057C 618 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 BAP3YDR046C 1815 nt7.89□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 PFS2YNL317W 1398 nt7.88□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 KTR4YBR199W 1395 nt7.88□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 RTG2YGL252C 1767 nt7.88□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 STE3YKL178C 1413 nt7.87□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 MFG1YDL233W 1377 nt7.87□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YLR358CYLR358C 564 nt7.87□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YNL295WYNL295W 1575 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 AOS1YPR180W 1044 nt7.85□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 CRN1YLR429W 1956 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 DIA4YHR011W 1341 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 RRP43YCR035C 1185 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 HAM1YJR069C 594 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 PRE5YMR314W 705 nt7.84□□□□□ -1.15
VPS54Q12071 HSV2YGR223C 1347 nt7.83□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 ERV2YPR037C 591 nt7.83□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 TPO1YLL028W 1761 nt7.82□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 AIM34YMR003W 597 nt7.82□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 TES1YJR019C 1050 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 CDA1YLR307W 906 nt7.81□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 YIL177CYIL177C 5277 nt7.8□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 INP54YOL065C 1155 nt7.8□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 GCD11YER025W 1584 nt7.8□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 PSA1YDL055C 1086 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 YJR142WYJR142W 1029 nt7.79□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 SLM3YDL033C 1254 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 SPS1YDR523C 1473 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 FRT1YOR324C 1809 nt7.78□□□□□ -1.16
VPS54Q12071 DOC1YGL240W 753 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 NMA2YGR010W 1188 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 YHR033WYHR033W 1272 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 STS1YIR011C 960 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 SDH8YBR269C 417 nt7.77□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 PMT1YDL095W 2454 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 GGC1YDL198C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 AVL9YLR114C 2295 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 ITR1YDR497C 1755 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 ERV25YML012W 636 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 YML079WYML079W 606 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 MDH2YOL126C 1134 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 YPL247CYPL247C 1572 nt7.75□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 PIH1YHR034C 1035 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 RPR1RPR1 369 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 MAM3YOL060C 2121 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 YPC1YBR183W 951 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 YEL023CYEL023C 2049 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 HOG1YLR113W 1308 nt7.74□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 ADH6YMR318C 1083 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 ATP23YNR020C 813 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 MSI1YBR195C 1269 nt7.73□□□□□ -1.17
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