Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 AAC3YBR085W 924 nt7.79□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 ADE2YOR128C 1716 nt7.78□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 YDR476CYDR476C 675 nt7.78□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 YJL043WYJL043W 774 nt7.78□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 PET494YNR045W 1470 nt7.78□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 CTF3YLR381W 2202 nt7.78□□□□□ -1.16
RPN8Q08723 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 YIR035CYIR035C 765 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 NUP53YMR153W 1428 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 YER152CYER152C 1332 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ERR3YMR323W 1314 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ERR1YOR393W 1314 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ERR2YPL281C 1314 nt7.77□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 SNU66YOR308C 1764 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 MET13YGL125W 1803 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 WSC4YHL028W 1818 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 YPT31YER031C 672 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 YMR253CYMR253C 1245 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 PDC6YGR087C 1692 nt7.76□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 UTR5YEL035C 501 nt7.75□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 MET22YOL064C 1074 nt7.75□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 NDE2YDL085W 1638 nt7.74□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ECM10YEL030W 1935 nt7.74□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 NDE1YMR145C 1683 nt7.73□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ATO2YNR002C 849 nt7.73□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 ATP2YJR121W 1536 nt7.73□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 MAS1YLR163C 1389 nt7.72□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 GNP1YDR508C 1992 nt7.71□□□□□ -1.17
RPN8Q08723 PMU1YKL128C 888 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 BXI1YNL305C 894 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 MAM3YOL060C 2121 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 RPS6AYPL090C 711 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 RPS6BYBR181C 711 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 SGF73YGL066W 1974 nt7.7□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 YJR149WYJR149W 1215 nt7.7□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 YPL247CYPL247C 1572 nt7.7□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 YIL108WYIL108W 2091 nt7.69□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 AQR1YNL065W 1761 nt7.69□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 MRN1YPL184C 1839 nt7.68□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 RRT6YGL146C 936 nt7.67□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 TIF3YPR163C 1311 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 TMS1YDR105C 1422 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 MAS2YHR024C 1449 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN8Q08723 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 LRO1YNR008W 1986 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 YNL140CYNL140C 570 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 POB3YML069W 1659 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 MEP1YGR121C 1479 nt7.62□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 PMT1YDL095W 2454 nt7.62□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 YBR056WYBR056W 1506 nt7.62□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 GLY1YEL046C 1164 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 RNA170RNA170 169 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 BUB2YMR055C 921 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 RPR1RPR1 369 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 RHO1YPR165W 630 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 PSP2YML017W 1782 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 YKR018CYKR018C 2178 nt7.59□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 PUP3YER094C 618 nt7.59□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 COS10YNR075W 1125 nt7.59□□□□□ -1.19
RPN8Q08723 YIL168WYIL168W 384 nt7.58□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YLR358CYLR358C 564 nt7.58□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 CCR4YAL021C 2514 nt7.58□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 PRE10YOR362C 867 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 INO1YJL153C 1602 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 BUD31YCR063W 474 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YJL009WYJL009W 327 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YLR030WYLR030W 792 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 CPT1YNL130C 1182 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YNL040WYNL040W 1371 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 INM1YHR046C 888 nt7.55□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 CDC13YDL220C 2775 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 TIM50YPL063W 1431 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 TGL5YOR081C 2250 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 THI73YLR004C 1572 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 PDC5YLR134W 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 RSC9YML127W 1746 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YBL111CYBL111C 2004 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 YER137CYER137C 447 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 BNA3YJL060W 1335 nt7.52□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 LAT1YNL071W 1449 nt7.52□□□□□ -1.2
RPN8Q08723 HXT13YEL069C 1695 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 PUP2YGR253C 783 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 URA1YKL216W 945 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 YML079WYML079W 606 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 SPR1YOR190W 1338 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 DIP5YPL265W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 YEL023CYEL023C 2049 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 HAC1YFL031W 717 nt7.5□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 SEC24YIL109C 2781 nt7.5□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 FCP1YMR277W 2199 nt7.5□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 KTR4YBR199W 1395 nt7.49□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 TPO1YLL028W 1761 nt7.49□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 PRB1YEL060C 1908 nt7.48□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 JHD1YER051W 1479 nt7.48□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 RUP1YOR138C 2016 nt7.47□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 MSB3YNL293W 1902 nt7.47□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 PNS1YOR161C 1620 nt7.47□□□□□ -1.21
RPN8Q08723 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.46□□□□□ -1.22
RPN8Q08723 PIH1YHR034C 1035 nt7.46□□□□□ -1.22
RPN8Q08723 TDA4YJR116W 840 nt7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.1 ms