Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1Q04750 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1Q04750 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1Q04750 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1Q04750 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1Q04750 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1Q04750 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1Q04750 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top1Q04750 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms