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Protein–RNA interactions for Protein: Q04005
ATC1, Protein ATC1/LIC4, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ATC1
Q04005
THP3
YPR045C
1413 nt
6.51
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
SHO1
YER118C
1104 nt
6.51
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
FUN14
YAL008W
597 nt
6.51
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
TOS2
YGR221C
1869 nt
6.51
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
TUB4
YLR212C
1422 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
MPA43
YNL249C
1629 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
PPS1
YBR276C
2424 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
YKR012C
YKR012C
378 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
MRN1
YPL184C
1839 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
YKR018C
YKR018C
2178 nt
6.5
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
NIF3
YGL221C
867 nt
6.49
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
YBR226C
YBR226C
411 nt
6.49
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
RSC9
YML127W
1746 nt
6.48
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
PRB1
YEL060C
1908 nt
6.48
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
SDS24
YBR214W
1584 nt
6.48
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
ICL2
YPR006C
1728 nt
6.47
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
SGE1
YPR198W
1632 nt
6.47
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
YGR137W
YGR137W
375 nt
6.47
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
GYP8
YFL027C
1494 nt
6.47
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
VBA3
YCL069W
1377 nt
6.46
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
KTR4
YBR199W
1395 nt
6.46
□□□□□ -1.37
ATC1
Q04005
YLR460C
YLR460C
1131 nt
6.46
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
YOR389W
YOR389W
1875 nt
6.45
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
YNR001W-A
YNR001W-A
219 nt
6.45
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
RCF2
YNR018W
675 nt
6.45
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
MKK1
YOR231W
1527 nt
6.45
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
EHT1
YBR177C
1356 nt
6.44
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
RFS1
YBR052C
633 nt
6.44
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
WSC3
YOL105C
1671 nt
6.44
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
AGP2
YBR132C
1791 nt
6.44
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
DIP5
YPL265W
1827 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
YFR020W
YFR020W
699 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
HMS2
YJR147W
1077 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
RCF1
YML030W
480 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
MRP7
YNL005C
1116 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
ENO1
YGR254W
1314 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
TOD6
YBL054W
1578 nt
6.43
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
MAL31
YBR298C
1845 nt
6.42
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
NAS2
YIL007C
663 nt
6.42
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
YNL017C
YNL017C
339 nt
6.42
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
NSE5
YML023C
1671 nt
6.42
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
PPZ2
YDR436W
2133 nt
6.41
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
YFR006W
YFR006W
1608 nt
6.41
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
CHS7
YHR142W
951 nt
6.41
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
OLA1
YBR025C
1185 nt
6.41
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
POX1
YGL205W
2247 nt
6.41
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
SSC1
YJR045C
1965 nt
6.4
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
VTS1
YOR359W
1572 nt
6.4
□□□□□ -1.38
ATC1
Q04005
ATF1
YOR377W
1578 nt
6.4
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
RRP46
YGR095C
672 nt
6.39
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
SRF1
YDL133W
1314 nt
6.38
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
GDA1
YEL042W
1557 nt
6.38
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
SEC24
YIL109C
2781 nt
6.38
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
RMD8
YFR048W
1989 nt
6.37
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
YBL070C
YBL070C
321 nt
6.37
□□□□□ -1.39
ATC1
Q04005
GNA1
YFL017C
480 nt
6.36
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ATC1
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QCR6
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6.36
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ATC1
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PHB2
YGR231C
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YIL106W
945 nt
6.36
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ADH3
YMR083W
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6.36
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IDP3
YNL009W
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CDC16
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6.36
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ATG22
YCL038C
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PMT1
YDL095W
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ARO3
YDR035W
1113 nt
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CKB1
YGL019W
837 nt
6.35
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ATC1
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CDD1
YLR245C
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6.35
□□□□□ -1.39
ATC1
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MET22
YOL064C
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Q04005
NME1
NME1
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ATC1
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6.34
□□□□□ -1.39
ATC1
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MEU1
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1014 nt
6.34
□□□□□ -1.39
ATC1
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RNA170
RNA170
169 nt
6.34
□□□□□ -1.39
ATC1
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YER152W-A
YER152W-A
567 nt
6.33
□□□□□ -1.4
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Q04005
HRA1
HRA1
564 nt
6.33
□□□□□ -1.4
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Q04005
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YPL041C
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□□□□□ -1.4
ATC1
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YHL030W-A
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YFL052W
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Q04005
YLR280C
YLR280C
351 nt
6.28
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