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Protein–RNA interactions for Protein: P47057
SNX4, Sorting nexin-4, yeast
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423 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SNX4
P47057
YGR137W
YGR137W
375 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
SNA3
YJL151C
402 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
LEU2
YCL018W
1095 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
ARO3
YDR035W
1113 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
HMS2
YJR147W
1077 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
NAM8
YHR086W
1572 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
RQC1
YDR333C
2172 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
TPC1
YGR096W
945 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
CDA1
YLR307W
906 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
ELP6
YMR312W
822 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
WSC3
YOL105C
1671 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
YPI1
YFR003C
468 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
YPT11
YNL304W
1254 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
ALG7
YBR243C
1347 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SNX4
P47057
EHT1
YBR177C
1356 nt
6.9
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
CLN1
YMR199W
1641 nt
6.9
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
REX2
YLR059C
810 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
LEO1
YOR123C
1395 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
NOG2
YNR053C
1461 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
MTC6
YHR151C
1581 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
FLC2
YAL053W
2352 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
RIB2
YOL066C
1776 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
ERP2
YAL007C
648 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
YJL043W
YJL043W
774 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
IML3
YBR107C
738 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
ENB1
YOL158C
1821 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
RCF1
YML030W
480 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
CAB5
YDR196C
726 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
PAC10
YGR078C
600 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
AIM2
YAL049C
741 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
YPR126C
YPR126C
309 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
SEC23
YPR181C
2307 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
GPA1
YHR005C
1419 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
KIN1
YDR122W
3195 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
HHY1
YEL059W
309 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
SNF4
YGL115W
969 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SNX4
P47057
TKL2
YBR117C
2046 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
SNZ1
YMR096W
894 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
YOR012W
YOR012W
414 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
YBR284W
YBR284W
2394 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
TOS1
YBR162C
1368 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
GRH1
YDR517W
1119 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
RRN10
YBL025W
438 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
EFM1
YHL039W
1758 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
TCB1
YOR086C
3561 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
TPI1
YDR050C
747 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
MSS51
YLR203C
1311 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
FRE5
YOR384W
2085 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
YCR041W
YCR041W
333 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
LOT6
YLR011W
576 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
BIM1
YER016W
1035 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
SNP1
YIL061C
903 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
HNM1
YGL077C
1692 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
RSM7
YJR113C
744 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
ADH1
YOL086C
1047 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SNX4
P47057
CTI6
YPL181W
1521 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
HXT2
YMR011W
1626 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
AIM3
YBR108W
2844 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
RGT2
YDL138W
2292 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
GTT3
YEL017W
1014 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
YJL195C
YJL195C
702 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
DPH5
YLR172C
903 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
SNF7
YLR025W
723 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
YNR029C
YNR029C
1290 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
RTC2
YBR147W
891 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
PRY2
YKR013W
990 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
YLR112W
YLR112W
420 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
FCY2
YER056C
1602 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
FPR2
YDR519W
408 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
FUN14
YAL008W
597 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
VBA3
YCL069W
1377 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
HAM1
YJR069C
594 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
SLX5
YDL013W
1860 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
GLN3
YER040W
2193 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SNX4
P47057
PET10
YKR046C
852 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
VPS65
YLR322W
315 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
AOS1
YPR180W
1044 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
CYC8
YBR112C
2901 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
AVT4
YNL101W
2142 nt
6.7
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
CDC3
YLR314C
1563 nt
6.69
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
BRN1
YBL097W
2265 nt
6.69
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
NUP57
YGR119C
1626 nt
6.68
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
HXK2
YGL253W
1461 nt
6.68
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
YEL008W
YEL008W
381 nt
6.68
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
POP1
YNL221C
2628 nt
6.68
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
CCT5
YJR064W
1689 nt
6.68
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
GYP8
YFL027C
1494 nt
6.67
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
CYB2
YML054C
1776 nt
6.67
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
YNL200C
YNL200C
741 nt
6.67
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
YDR327W
YDR327W
327 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
MHF1
YOL086W-A
273 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
STE4
YOR212W
1272 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
NMT1
YLR195C
1368 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
NTG1
YAL015C
1200 nt
6.65
□□□□□ -1.34
SNX4
P47057
YGR127W
YGR127W
939 nt
6.64
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YHL030W-A
YHL030W-A
462 nt
6.64
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
CAR2
YLR438W
1275 nt
6.64
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
YLR460C
YLR460C
1131 nt
6.64
□□□□□ -1.35
SNX4
P47057
OLA1
YBR025C
1185 nt
6.64
□□□□□ -1.35
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